分析特點


 

脂質體圖譜分析 LIPID PROFILING ANALYSIS
     脂質體圖譜檢測獲得的原始數據是多維且複雜的,為了方便您資料的判讀,我們有提供標準化生物資訊分析服務,亦可根據您的需求提供客製化的高階分析服務。

分析內容:

Ø脂質剖析

        針對每一個試驗樣本進行大規模的綜合分析。包含統計每個樣本全脂質體的總表現量、表現脂質的個數、實驗組與控制組樣本脂質表現量的分佈、脂質類別的表現量、脂質類別的組成等,揭示樣本之間脂質表現量、脂質類別的差異。

Ø表現差異脂質分析

        計算全脂質體於實驗組與控制組兩組樣本之間表現量的差異倍數,藉此量化實驗組與控制組脂質表現量的差異程度,再根據雙樣本中位數差異檢定(Wilcoxon signed-rank test)p值篩選出顯著差異表現的脂質。篩選條件為當表現量差異倍數達2倍變化 (差異倍數增加2倍或減少2)p值小於0.05的脂質即被視為顯著差異表現的脂質。

Ø脂質類別富集分析

        依據化學結構上官能基的差異,脂質能再細分成超過20種脂質類別。我們將針對顯著差異表現的脂質,以費雪檢定和設定的p值判斷顯著差異表現的脂質在哪些脂質類別存在富集。

脂質生物解讀平台 TRANS-OMICS ANALYSIS
  我們目前已建立可跨體學將定序與質譜資料技術整合之『脂質生物解讀平台』,將脂質體之產物以類別或種類連結至生物功能,並以生物功能為平台,整合各個體學的資訊,進而得知影響該生物功能的轉錄體與脂質體。一般的實驗設計會希望透過比較實驗組與控制組,了解實驗組與控制組的差異,我們的分析策略也以此為基礎,不管是轉錄體或脂質體,將圖譜資料以差異倍數與統計檢定方式,篩選出實驗組與控制組之間顯著差異表現的基因或脂質,再根據我們建立的脂質生物解讀平台,比對轉錄體與脂質體共同影響的生物功能。

  跨體學 (Trans-omics)研究一直是當前系統性生物醫學研發的重點,但卻缺乏針對轉錄體與脂質體的整合分析。目前我們搜集了多個脂質相關的資料庫,包含KEGG (https://www.genome.jp/kegg/), GO (http://www.geneontology.org/), Lipid maps (https://www.lipidmaps.org/), Swiss lipid (http://www.swisslipids.org/), HMDB (http://www.hmdb.ca/), ChEBI (https://www.ebi.ac.uk/chebi/)。比較資料庫之間脂質命名規則的差異;整合各個資料庫與脂質相關的酵素、基因、生物途徑及生化反應等資訊;釐清轉錄體與脂質體上下游關係,系統性的解析轉錄體與脂質體於特定生物功能中扮演的角色。